El código omega 2, es la secuela de la película El Código Omega. La cinta es más una película alterna del filme original, que una continuación.
Stone Alexander, un hombre poderoso, tiene un plan maligno para erradicar a toda la humanidad.
Solo una persona puede detenerlo: su hermano David, el presidente de los Estados Unidos de América. No obstante, David va a necesitar el poder de Dios para liderarle en la guerra, mantener su espíritu fuerte y ayudarle a revelar la verdadera naturaleza de esta batalla.